农药登记制度是为了有效控制无效或低效甚至有害的农药产品进入市场而实行的，直接对研发、合成、加工、包装、运输、销售、使用、废弃物的排放处理及用后的环境和生态监测各个环节均都有特殊的技术要求进行检验和审查，对最大限度地减少农药对自然界的危害有重要的作用，也影响着农药行业的发展。
中投顾问化工行业研究员常轶智指出，农药是一种特殊的商品，直接应用于农业生产中，对农业生产和农产品质量安全，以及农产品贸易和生态环境安全都有很大的影响。因此，农药的质量和管理问题备受人们关注，而相关的农药管理制度也就显得尤为重要。
过去，我国为了满足农业生产的需求，促进农药行业的发展，对农药登记的要求比较低。近年来，随着我国农业发展方式的转变，加上人们对农产品质量要求的逐渐提高，对农药管理法规及配套规章的要求也越来越高，而以往的农药登记制度也渐渐不能适应社会发展的要求，逐渐的暴露出一些问题。
首先，在生产过程方面，由于过去过低的农药登记要求，我国许多农药企业对农药技术研发工作很不重视。据中投顾问发布的《2010-2015年中国农药市场投资分析及前景预测报告》显示，有的企业不仅对自己产品的生产技术原理、产品的理化和生物性能及其使用技术要点不清楚，而且在申请农药登记田间试验时还不知道单位面积应该使用多少量。这些关系企业切身利益的问题都如此漠视，更谈不上要重视在生产过程中对人员的健康保护等问题了。
其次，在生产的产品方面，由于过低的农药登记要求和成本，造成我国登记的农药产品数量过多、过乱。例如，我国很多企业都登记许多防治相同虫害的同种农药，而且同一个企业登记防治相同对象的同种或不同种农药的多个产品，每个产品的市场份额很小。还有的企业不仅没有研发技术，甚至对农药科学知识也缺乏了解，其产品质量和售后的技术服务自然也就难以得到保证。此外，对新药的界定标准也不合格。据相关数据显示，我国每年有15000多种新药，而美国只有三四十种。
常轶智认为，在行业发展中，不可避免的都会发生一些阻碍行业健康发展的问题，重要的是相关部门要根据实际情况对相应的制度做出改变。现在，针对这些问题，我国相关部门已经制定了相关的政策和规定，并对农药登记制度作了相应的修订。例如，对提高资料登记要求，对相同农药产品做实验等相关措施的拟定。今后，随着我国社会经济的不断发展，我国农药登记制度也将会逐步完善
