在化工产业链中，上游原料来自石油、煤炭、天然气等能源产品，一旦煤价、油价上涨，将会推动氮肥成本上升，尤其是62%以煤为原料的煤头企业，这时，以天然气为原料的企业优势更加明显。
按照计算，2008年，以石油、煤炭、天然气为原料的化肥企业平均生产成本分别约为1300元/吨、1200元/吨和1000元/吨。如果规模更加大，以天然气为原料的生产企业，其成本可以控制在850元/吨左右。
2007年，氮肥价格曾经深幅下跌，由于生产成本持续上升，一些企业的氮肥价格几乎降到最低出厂价1400元/吨以下，全行业面临亏损。但自从2007年第四季度出口关税由30%降为15%，氮肥出厂零售价由2007年9月中旬的1600元/吨在几个月内急剧上升了200～300元/吨，涨势猛烈，全行业迅速走出低谷。
由于全球氮肥需求量不断增加，2008年以来，国际化肥供不应求，国际价格大幅上涨。截至8月份，国内外尿素差价较大，国外价格大约为800美元/吨，而国内只有2000多元人民币/吨，有较强的出口竞争力。为抑制化肥产品出口过快增长，满足国内市场需求，我国2008年以来曾多次调整化肥类商品出口关税。先是在4月20日至9月30日的用肥旺季内，所有化肥及部分化肥原料加征100%的特别出口关税。受此影响，第二季度氮肥出口环比大幅下降；之后，从9月1日起至年底，氮肥及合成氨的特别出口关税又上调150%，其他化肥及化肥原料四季度继续征收100%特别出口关税。
以尿素为主的氮肥出口关税的提高，实际上体现了国家一箭三雕的宏观调控艺术。首先，氮肥的原料是煤炭，而氮肥基本上不算附加值很高的工业产品，出口氮肥，就相当于出口煤炭这种基本矿产资源，所以，在转变经济增长方式的今天，国家还是希望更多地出口高附加值产品。其次，尿素价格上涨，受害最深的是使用化肥的广大基层农民，抑制化肥出口，就等于大大增加了化肥的国内供应量，化肥价格自然下落，受到实惠的是农民。第三，如果在某些短时期内，化肥的国内外价格存在很高的价差，生产厂商为了谋取更大的商业利润，还是希望进行一定数量的出口，国家税收也可比加税前增加。
事实上，增加出口关税的效果在今年的10月份就初步显现了。10月份，氮肥均价较上月大幅下降10.28%至1920元/吨。目前由于国内市场用肥将陆续结束，传统淡季来临，市场将继续在低迷中度过，成交清淡。目前1700~1800元/吨的水平很难回升(见附图)。与此同时，由于考虑到煤炭价格成本的支撑，这轮化肥的价格跌幅可能会相应收窄，但是低迷的行情将持续，价格也有继续下跌的可能。但是，也有观点认为经过2007年以来煤炭、电力、蒸汽等价格的上涨，国内每吨氮肥的成本已经高达1800~1900元/吨，因此即使出口受挫，国内价格下跌，跌幅空间也有限。
