当前农药产业面临新老矛盾相互交织的挑战。
一是农药产能过剩仍在加剧。农药产量突飞猛进地大增，而需求量仅占农药产量不到1/8。可以说，产能严重过剩无时无刻都在威胁着我国农药行业。近几年来，农药生产企业对较有亮色的产品一哄而上、盲目扩张已成了通病。如我国主流药剂吡虫啉、阿维菌素、草甘膦、乙草胺呈现严重供大于求状况均是企业追求效益最大化盲目投资上马所致。
二是农药安全性要求越来越高。目前，消费者对于农产品中农药残留的“零容忍”态度，使得农药在满足病虫害防治、保障粮食丰收的同时，其安全性越来越受到关注。因此，农药企业的生产、经营理念，质量全程控制机制，农药使用者的用药水平，行业相关各主体社会责任意识等，还需要不断加强。
三是农药制假行为更加隐蔽。2010年农药质量抽检中，蓄意造假、违法添加其他农药有效成分的样品占8.0%，占不合格样品的 57.5%。在农药质量总体提高的同时，假农药所占的比例也在提高；非法经营、制假售假更加隐蔽，增加了查处难度。
四是农药违规使用难以禁止。我国现有的分散式小农生产方式，农民安全用药水平较低，决定了农药不合理使用、违规使用在相当长时间仍将存在。从今春海南豇豆检出水胺硫磷，到最近北京检出福建乌龙茶含有三氯杀螨醇，都是限用农药被违规使用。
在面临挑战的同时，农药产业也充满机遇，农药产业的 “十二五”，将会是充满前途的五年。
一是农药刚性需求不会改变。中国是农业大国、人口大国，粮食安全问题始终是治国安天下的首要问题。要在有限的耕地上生产更多的农产品，离不开农药防治作物病虫害保障粮食丰收的巨大作用。
二是中国农药企业充满活力。中国成为世界第一农药生产和出口国，已经说明众多中小企业在成长，国家农药工业腾飞的基础在增强。随着国家产业政策推动兼并重组的步伐加快，广大企业苦练内功，重视自主创新，这种活力会更加猛烈迸发出来。
三是国家政策为农药发展提供坚实保障。《农药产业政策》的出台，《农药管理条例》的修订，均表明国家农药管理政策、法规环境，正在引导农药行业发展的大方向，必将有力推动“十二五”农药行业又好又快发展。
