尽管生物农药是我国实现高毒农药替代、农药工业可持续发展的必然趋势，但是目前由于生物农药本身的特点和推广力度不够等原因，生物农药的发展大受局限。
产品叫好不叫座
国务院参事、原农业部副部长刘坚指出，生物农药在低碳经济、循环经济时代具有突出的优点，生物农药以可再生的农产品为主要原料，不使用化石能源，可被自然界降解，能有效避免使用化学农药造成的农药残留，是保证环境安全和食品安全的有效手段，代表了现代农药发展的必然趋势。鉴于这些优点，各国长期以来都努力推动发展生物农药，1992年世界环境与发展大会曾提出，到2000年生物农药的产量占世界农药总产量的60%。之后虽然全球直接应用的生物农药产量逐年增加，但现在都2010年了，目前世界生物农药用量也仅占7%，距当时定下的2000年目标仍有很大的差距。据美国商业通信公司（Business Communications Company）的研究报告统计，2010年全球生物农药仅为10亿美元。
农业部农药检定所药政处处长季颖介绍说，国内外对生物农药没有统一的定义，一般分为微生物农药、农用抗生素、植物源农药、生物化学农药、转基因生物、天敌生物等，目前我国生物农药登记的有效成分有70多个，产品2500多个，产量超过10万吨，使用面积约为10亿亩次，但如果不考虑原药高毒的阿维菌素系列产品，则产品仅为1100个左右，而且产量、使用面积均较低。
行业亏损严重
据了解，我国生物农药产量每年增加约 4%，基本处于停滞不前状态，在品种和用量上，都和欧美发达国家有不少的差距。目前欧美生产的生物农药约占全球市场的65%，而我国除了井冈霉素、苏芸金芽孢杆菌（Bt）等个别产品，其他产品市场份额极少。
中国工程院院士沈寅初介绍说，我国生物农药产业起步比国外并不晚，在上世纪七八十年代时，我国曾经采取政府补贴和免税等措施，大大促进了井冈霉素等产品的推广。近年来，由于发酵工艺的提高，井冈霉素等产品的价格大幅下降，反而由于利润太低而不受经销商的重视，产量有所下降。国内最早从事Bt研究和产业开发的专家之一、武汉科诺生物董事长谢天健研究员告诉记者，目前Bt虽然是产销量最多的几种生物农药产品之一，但是整个行业基本上属于半亏损状态，业内企业经过多次洗牌仅留下少数骨干企业，却仍有部分企业要依靠其他产品盈利弥补生物农药的亏损。由于国内生物农药市场的不景气，作为国内最大的企业，武汉科诺的大部分Bt产品出口国外。
多因素局限发展
全国农业技术推广服务中心防治处高级园艺师郭荣认为，我国生物农药市场增长速度比较缓慢，在防治面积、市场份额等方面没有突破，这主要是由于生物农药自身存在不足，覆盖的靶标病虫范围比较小，使用技术要求较高，药效发挥受环境因素影响较大，速效性普遍差，价格相对偏高，难以与化学农药相抗衡。在推广和应用中，由于国家植保推广体系的不健全，农民对生物农药的应用缺乏积极性，生物农药难以推广和广泛应用。
科技部农业科技司王亚武博士指出，我国生物农药生产企业约260家，除井冈霉素和Bt原药的个别大企业外，其他规模都比较小，原创性技术较少，技术力量薄弱。目前我国生物农药在诊断、制剂工艺和环境监测等环节少缺乏配套技术，产业体系不健全，可持续发展面临挑战。
