从当前化肥市场来看，存在着三种不良偏向，需要各方注意，并且加以克服：
第一，价格大战造成企业效益低下。
一是企业为抢占、市场份额“放血压价”。化肥行业本身应是微利行业，一些企业为了把自己的产品推销出去，不是从提高产品质量、服务质量方面想办法扩大销路，而只是单纯靠降价与别人竞争。有的为了独占市场，甚至以低于成本价倾销，造成企业亏损，这样越销得多，企业亏损就越大。
二是有的企业为了生存，看到别人降价，自己不降怕销不动，无奈之下也跟着降价。这样你降我也降，他看我降就再降，我见他降又跟上，形成了恶性循环。降价使得一些原来效益较好的企业现在往往只能维持生产和发放工资；那些只能维持生产的企业降来降去，加之货款回笼不及时，已是无力运转。
三是化肥品种供求平衡，商家、农民选购时层层压价。
目前的化肥价格已到低谷。由于重复建设，有的一个地区有多个磷肥厂，有的地区、县都有氮肥厂，使得一些经销商同一种规格肥料就销好几个厂家的。这样农民有很大的选择余地。价格低当然卖得快。反过来商家给厂家信息：“不降价，销不动。 ”就这样商家、农民“联合”迫使厂家降价。
第二，假劣不止，严重影响到农民权益和企业的正常生产。
其一，生产厂家对产品出厂把关不严，短斤少两，含量不达标的现象时有发生。根据有关报道，中小企业抽查合格率比大中型企业平均低15%--20%。农民为了保护自己的利益，尽管进口肥比国产肥价高也争着要，直接影响到农民施用国产肥的积极性以及国内化肥企业的经济效益。
其二，制造假冒伪劣产品在一些地方仍有发生。据有关报道，去年质量技术监督部门查获的假冒伪劣农资产品总值近6亿元。有的假冒伪劣产品是由根本不具备基本条件，没有规模，没有合格原料和合格工艺的的企业生产的，甚至是由手工土法生产，而且越是名牌优质产品就越有众多的假冒者追随。年年打假，年年打不尽，严重地干扰了正常的经济秩序，不但坑害了农民，而且给一些厂家在信誉上造成了严重的影响，甚至被搞得无法正常进行生产。
第三，地方封锁，使得厂家直销难以进行。
随着化肥流通体制的改革，原来厂家销售的合作伙伴也发生了很大变化。现在农资部门有的重组改制，有的被租赁，有的承包到个人。为了搞好化肥淡季储存，避免经销商层层批发杀价，抓好贷款的及时回笼，根据国务院有关文件精神，除继续发挥农资部门的中介作用外，不少厂家面向农村、集镇建成了自己的产品直销点，既减少了三级批发的差价，又避免了假冒伪劣产品，很受农民欢迎。但由于地方保护主义作怪，一些地方为了保护本地的化肥厂或维护好本地农资部门的效益，制定了土政策，要当地的工商管理部门不给厂家直销点发证，或要监督部门经常去查问，搞得你无心经营。有的地方甚至还组织人员设卡、堵截、扣留外地企业的直销产品，给企业的生产经营造成极大的困难。
