自9月1日起，对纳税人销售和进口的化肥，统一按13%税率征收增值税，原有的增值税免税和先征后返政策相应停止执行。这意味着，化肥行业的市场化道路正式拉开序幕。
自1994年以来，我国陆续对国内生产流通和进口的部分化肥品种，实行免征或者先征后返增值税，在保障化肥供应、支持农业生产等方面发挥了积极作用。但随着国内外供应形势的变化，这些政策的弊端日益显现：一方面氮肥和磷肥产能过剩日趋严重，钾肥市场也出现供过于求的市场局面，出口市场持续疲弱、企业开工率较低、多数企业处于亏损的困境。国内化肥产能过剩压力巨大，亟须缓解。
另一方面，我国农民长期过度施用化肥，导致土壤质量和生态环境遭到破坏。为此，国家提出化肥用量在2020年实现零增长的目标。
“恢复化肥增值税就是为了实现上述两个目标，也体现了政府用‘市场之手’调节行业发展的决心。”东方艾格分析师于美华在接受本报记者采访时说。
化肥复征增值税，对化肥生产企业来说，无疑是一次巨变。于美华指出，在氮、磷、钾、复合肥中，由于氮肥和磷肥企业的纳税人可以将原来计入成本的煤、电、硫磺、氨、磷矿石等原料购进时支付的增值税额从成本中剥离出来，用作进项税抵扣。已经实施“营改增”的运输费用、仓储费用，动产设备购进价款中所含的进项税，以及即将启动的房地产“营改增”之后再建立的厂房，都可以进项抵扣。因此，对氮肥和磷肥行业影响较小，平均每吨成本约提高40~50元。
而对资源型钾肥来说，增值税的影响较大，预计每吨出厂成本上涨150~200元。由于我国钾肥进口依赖度较高，中化化肥有限公司钾肥部副总经理郭强表示，增值税征收后，对进口钾肥的影响大于国产钾肥。
为此，8月28日，财政部、国家税务总局联合发布了《国家关于对化肥征收增值税的补充通知》(以下称《补充通知》)，规定自2015年9月1日起至2016年6月30日，对增值税一般纳税人销售的库存化肥，允许选择按照简易计税方法依照3%征收率征收增值税。
中国无机盐协会钾盐(肥)行业分会常务副秘书长亓昭英表示，此次《补充通知》体现了国家对化肥行业的支持，给予了化肥行业半年多的缓冲时间，对于化肥行业的长期稳定发展有重大促进作用。
业内专家表示，从短期来看，征收增值税对企业不利，但长远来看将适度提高化肥企业成本，加速淘汰规模小、设备落后、盈利能力差的小企业，有利于化肥行业竞争格局优化，提升化肥行业运行的规范度。
作为终端消费者，化肥成本上去了，会不会加重农民的负担?
在于美华看来，在当前产能过剩的情况下，市场价格是否会随着成本增加而上扬，还要取决于市场能否接受和农民的购买力。由于国家设有农资综合补贴，并实施动态调整等制度安排，即使化肥价格出现一些波动，对正常的农业生产和农民增收不会产生大的影响。同时，政府可以将税收补贴给农民，引导企业做好农化服务。
